2013年，在发现希格斯玻色子的阴影下，瑞士核研究机构“欧洲核子研究中心”启动了一项秘密计划。这个计划的名字是“尼安蒂克计划”。它的目的是研究干扰人类精神的未知物质。这种物质被称为“奇异物质”（XM），自古以来就一直在感知人们的精神和能力，甚至对人类历史产生了巨大影响。世界各地的机构都在秘密进行这项研究。XM被视为对人类的希望或威胁，大国和大型企业已经爆发了一场争夺战。接受XM的力量，并准备将其用于人类进化的“启蒙军”。将XM视为一种威胁，并准备将其作为“反叛力量”加以控制。世界被分为这两个阵营，斗争一直持续到今天。在这个世界上发生的斗争背后是XM的存在。之后，在2018年。以东京和世界为舞台，围绕XM展开一场新的战斗。将动画、在线位置信息游戏和现实联系在一起，一种前所未有的全新“增强现实娱乐”已经开始。